太虚图书馆坐落在闽南佛学院内的方丈楼与教学楼之间，位于丛丛疏竹的清凉绿影之畔。站在图书馆前，迎目而来的是赵朴初老居士所题写的"太虚图书馆"金字黑底的五个大字。进入图书馆，馆内窗明几净，书架严整，各类图书按佛教图书分类法整齐排列，令人身心为之一静。

闽南佛学院从创办初期，前辈办学者皆注重图书的购置和收藏。历史上的闽院曾有丰厚藏书，文革期间，寺院遭毁，图书被抄一空。1989年，太虚图书馆落成。现存有七种版本的大藏经共九套，其他各种书籍约两万册。如今馆藏图书在院长、副院长和馆长的关心下不断添加，已成为闽院学子深入经藏的一大宝室，也将成为闽南佛学文献资料的收集中心。